プリアンプで完全に音作ってる場合は
あんまりエフェクト音に影響無いと思うが
要するに最近のハイゲインアンプと同じ回路構成にしてるわけで

パワーアンプで音作る場合は
エフェクトループにラインミキサーとか
通した方が影響無いのかな？