ネック反ってるかフレット浮いてるか、その両方か
サドル低過ぎナットの溝が深過ぎとか
それがひとつの原因か複合的な原因か見ないと分からないけど。

チョーキングするんだからハイポジだよね？
だったらネックが起きてる可能性もあるし

お店に出してネック調整、擦り合わせ、ナット、サドルも診てもらった方がいいよ。