考えられる原因
1.ハーモニクスポイントの違い
ネックスケール、ブリッジの形状でハーモニクスポイントが違ってくる
2.同じ仕様のギターでも「個体差」で違ったりする
対策
1.ピッキングする位置を変える
2.アンプやペダルのセッティングを変える

つかどうでもいいことではない気がするけどなんでここで訊くのかしら