天皇家の由来のY染色体が現在日本の集団内で大多数を占めるという結論は正しい。
その理由は二つ。一つは、天皇家のY染色体は繁殖成功しやすいこと、もう一つが、そもそも現在まで残っているY染色体は、殆どが「集団内で主流の系統」であること。歴代の天皇は、子供を数十人ももうけるのが珍しくなかった。
この為、同世代の「ライバルのY染色体に対して優位」となる。また傍流は臣籍降下し皇室を離れた人たちも、一般庶民と比較すれば繁殖に有利なこともあり、この場合、臣籍降下して一般人となった人々も同じY染色体が受け継がれ繁殖を拡大して行くこととなり得るのである。
欧州の王侯貴族と比較してY染色体を何十世代に渡って継承することが確立論的にあり得ないとの主張があるが、比較対象となる欧州の王侯は、キリスト教受容以降一夫一婦制であり、明治まで一夫多妻制であった日本とは比較の対象となり得ない。