大バッハなら大バッハ本人がもういないんだから、
移調して編曲して演奏する事の良し悪しを論じても意味ないと思う。

文句言えるのは作曲した大バッハ本人だけ。
もういないんだから好きに演奏すればいいよ。

そもそも、仮に同じ調で演奏したとしても、
「ギター用に作曲した訳じゃないし、ギターで演奏するのやめてくれない？」と答えるかもしれん。