Ph.D.は、正式には、Doctor of Philosophy in〜であって、
これ自体が、伝統的な言い方というか、昔の名残である。

そういうわけで、Doctor of Philosophy in Physics
これは、古典文学っぽく訳せば、、自然学に於ける哲学の博士ということになる。
長たらしいから縮めようというのならば、自然哲学博士、だろう。